Showing metabocard for KDO-lipid IV(A) (MMDBc0031618)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2021-11-18 01:41:37 UTC | ||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-08-31 18:22:32 UTC | ||||||||||||||||||||||||||
MiMeDB ID | MMDBc0031618 | ||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||
Common Name | KDO-lipid IV(A) | ||||||||||||||||||||||||||
Description | KDO-lipid IV(a) is a part of lipopolysaccharide or LPS. Specifically it is lipid IVA glycosylated with a single 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (KDO) residue. KDO-lipid IV(a) is a saccharolipid. The most familiar saccharolipids are the acylated glucosamine precursors of the lipid A component of the lipopolysaccharides in Gram-negative bacteria. Typical lipid A molecules are disaccharides of glucosamine, which are derivatized with as many as seven fatty-acyl chains. The minimal lipopolysaccharide required for growth in E. coli is Kdo2-Lipid A, a hexa-acylated disaccharide of glucosamine that is glycosylated with two 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid (Kdo) residues. | ||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C76H142N2O30P2 | ||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 1625.8836 | ||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 1624.912264238 | ||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
SMILES | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C76H142N2O30P2/c1-5-9-13-17-21-25-29-33-37-41-53(80)45-61(86)77-65-71(104-63(88)47-55(82)43-39-35-31-27-23-19-15-11-7-3)68(91)59(102-74(65)108-110(97,98)99)51-100-73-66(78-62(87)46-54(81)42-38-34-30-26-22-18-14-10-6-2)72(105-64(89)48-56(83)44-40-36-32-28-24-20-16-12-8-4)70(107-109(94,95)96)60(103-73)52-101-76(75(92)93)49-57(84)67(90)69(106-76)58(85)50-79/h53-60,65-74,79-85,90-91H,5-52H2,1-4H3,(H,77,86)(H,78,87)(H,92,93)(H2,94,95,96)(H2,97,98,99)/t53-,54-,55-,56-,57-,58-,59-,60-,65-,66-,67-,68-,69-,70-,71-,72-,73-,74-,76-/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | GPNCBCJEDRRCDW-ACUQGRCXSA-N | ||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as acylaminosugars. These are organic compounds containing a sugar linked to a chain through N-acyl group. | ||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organic oxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||
Class | Organooxygen compounds | ||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Carbohydrates and carbohydrate conjugates | ||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Acylaminosugars | ||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents |
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Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations |
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Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||
Proteins | |||||||||||||||||||||||||||
Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||
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Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources |
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Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||
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Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | C06024 | ||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 25203768 | ||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 27439 | ||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||
General References |
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