Showing metabocard for Cobyrinate (MMDBc0048054)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 1.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2022-04-29 21:47:01 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-09-01 02:14:04 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiMeDB ID | MMDBc0048054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Cobyrinate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Cobyrinsaeure, also known as cobyrinic acid or cob(ii)yrinate, belongs to the class of organic compounds known as metallotetrapyrroles. These are polycyclic compounds containing a tetrapyrrole skeleton combined with a metal atom. Based on a literature review very few articles have been published on Cobyrinsaeure. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C45H59CoN4O14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 938.913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 938.334874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | [(1R,2R,3S,4S,8S,9S,14S,18R,19R)-4,9,14,18-tetrakis(2-carboxyethyl)-3,8,19-tris(carboxymethyl)-2,3,6,8,13,13,16,18-octamethyl-20,21,22,23-tetraazapentacyclo[15.2.1.1^{2,5}.1^{7,10}.1^{12,15}]tricosa-5(23),6,10(22),11,15(21),16-hexaen-20-yl]cobaltbis(ylium) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(1R,2R,3S,4S,8S,9S,14S,18R,19R)-4,9,14,18-tetrakis(2-carboxyethyl)-3,8,19-tris(carboxymethyl)-2,3,6,8,13,13,16,18-octamethyl-20,21,22,23-tetraazapentacyclo[15.2.1.1^{2,5}.1^{7,10}.1^{12,15}]tricosa-5(23),6,10(22),11,15(21),16-hexaen-20-yl]cobaltbis(ylium) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | [H][C@]12[C@H](CC(O)=O)[C@@](C)(CCC(O)=O)\C(N1[Co++])=C(C)\C1=N\C(=C/C3=N/C(=C(C)\C4=N[C@]2(C)[C@@](C)(CC(O)=O)[C@@H]4CCC(O)=O)/[C@@](C)(CC(O)=O)[C@@H]3CCC(O)=O)\C(C)(C)[C@@H]1CCC(O)=O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C45H60N4O14.Co/c1-21-36-24(10-13-30(52)53)41(3,4)28(47-36)18-27-23(9-12-29(50)51)43(6,19-34(60)61)39(46-27)22(2)37-25(11-14-31(54)55)44(7,20-35(62)63)45(8,49-37)40-26(17-33(58)59)42(5,38(21)48-40)16-15-32(56)57;/h18,23-26,40H,9-17,19-20H2,1-8H3,(H8,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63);/q;+3/p-1/t23-,24-,25-,26+,40-,42-,43+,44+,45+;/m1./s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | SXATWJGWOIKDIW-OKJGWHJPSA-M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as metallotetrapyrroles. These are polycyclic compounds containing a tetrapyrrole skeleton combined with a metal atom. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Organoheterocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Tetrapyrroles and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Metallotetrapyrroles | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Metallotetrapyrroles | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic heteropolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors |
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Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biospecimen Locations |
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Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteins | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways |
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Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Microbial Sources |
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Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 17625694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 16722116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | 33907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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